Le CIR a fourni un soutien pour identifier les principales contraintes qui ont pesé sur l'intégration du Soudan du Sud dans l'économie mondiale et déterminer comment le pays peut tirer parti du système commercial multilatéral.
Le Programme aide actuellement à renforcer les institutions et définit un certain nombre de stratégies pour les secteurs productifs afin d'aider le pays à mieux profiter des avantages du commerce international.
Le CIR s'emploie à soutenir les opérations et les activités du Ministère du commerce et de l'industrie, principal organisme chargé d'élaborer et de mettre en œuvre la politique commerciale au Soudan du Sud. Il s'agit notamment de renforcer les capacités des institutions; d'accorder la priorité au commerce dans les divers secteurs de l'économie; de coordonner et d'associer les parties prenantes aux efforts de développement du commerce; et de mobiliser des ressources pour le commerce et le développement.
Par ailleurs, l'accent est mis sur le soutien pour "le commerce et la paix", ainsi que l'accession du pays à l'OMC.